Bermula dari Balai Pengobatan yang diprakarsai oleh Pimpinan Ranting Muhammadiyah Babat Barat pada tahun 1968, bertempat di rumah bpk H. Abdur Rosyid (alm) di jalan Pendidikan Babat.
Berselang kira-kira 2 tahun berikutnya, tepat pada tahun 1970 ibu-ibu Aisyiyah Cabang Babat mendirikan Balai Kesejahteraan Ibu dan Anak (BKIA) yang berada di jalan Raya 168 Babat.
Berhubung permintaan dan kepercayaan masyarakat semakin tinggi sehingga pelayanan tidak hanya sebatas anak dan bersalin saja. Pada pertengahan tahun 1997 Alhamdulillah mendapatkan ijin sementara sebagai RSIA MUHAMMADIYAH BABAT dengan direktur dr. H. Moh Thohir, HS.
Usaha tersebut juga dibarengi dengan perluasan lahan dan perbaikan fasilitas di segala bidang. Saat ini RS Muhammadiyah Babat memiliki total luas tanah 1.422 m. Lahan yang sudah terpakai dengan luas bangunan 1.966,95 m dan sisa lahan digunakan sebagai tempat parkir, taman, jemuran, serta IPAL